Theo quy định tại điều 168 BLTTDS 2004 thì thời hiệu khởi kiện đã hết là một trong những căn cứ để Tòa án trả lại đơn khởi kiện cho người khởi kiện. Việc xác định đúng thời hiệu khởi kiện cũng như các điều kiện khác để thụ lý vụ án là rất quan trọng. Tuy nhiên, theo quy định tại điều 168 Bộ luật Tố tụng dân sự sửa đổi, bổ sung 2011 (có hiệu lực từ 01/01/2012) thì Tòa án không được trả lại đơn khi thời hiệu khởi kiện đã hết. Có nghĩa là kể cả trong trường hợp thời hiệu khởi kiện đã hết thì Tòa án cũng phải thụ lý vụ án. Quy định này một phần bảo vệ quyền lợi của người khởi kiện tạo điều kiện thuận lợi cho người dân tiếp cận công lý, người dân chỉ nộp đơn đến Tòa án, Tòa án có trách nhiệm nhận và thụ lý đơn, tuy nhiên bên cạnh đó quy định này sẽ gây khó khăn trong việc giải quyết đơn khởi kiện cũng như giải quyết vụ án nếu như được thụ lý. Bởi lẽ, thời hiệu khởi kiện là căn cứ quan trọng xác định người khởi kiện có quyền khởi kiện nữa hay không, khi thời hiệu khởi kiện đã hết tức là người khởi kiện không còn quyền khởi kiện nữa, Tòa án không có căn cứ chấp nhận yêu cầu khởi kiện của nguyên đơn. Bên cạnh đó điều 192 Bộ luật Tố tụng dân sự sửa đổi, bổ sung quy định thời hiệu khởi kiện đã hết là một trong các căn cứ để đình chỉ giải quyết vụ án. Như vậy theo quy định của tố tụng dân sự đã được sửa đổi, bổ sung thì những vụ án hết thời hiệu khởi kiện Tòa án vẫn phải thụ lý, sau khi thụ lý Tòa án lại ra quyết định đình chỉ giải quyết vụ án, từ đó kéo theo số lượng vụ án sẽ tăng lên rất nhiều, khối lượng công việc mà Tòa án phải giải quyết càng lớn, cũng không giải quyết được yêu cầu của các đương sự khi khởi kiện tại Tòa án. Khi Luật sửa đổi, bổ sung Bộ luật tố tụng dân sự có hiệu lực thi hành đối với các vụ án hết thời hiệu khởi kiện có lẽ Thẩm phán được phân công giải quyết đơn khởi kiện chỉ có thể thuyết phục đương sự tự nguyện rút đơn khởi kiện, nếu đương sự không rút đơn khởi kiện Tòa án sẽ phải thụ lý theo đúng quy định sau đó lại ra Quyết định đình chỉ giải quyết vụ án. Quy định này thật sự chưa phù hợp mà nên giữ nguyên căn cứ trả lại đơn khởi kiện khi thời hiệu khởi kiện đã hết như quy định tại điều 168 Bộ luật Tố tụng dân sự 2004.
